検索の仕方
HOMEの検索画面上で、目的遺伝子の遺伝子名(gene symbol)を入れて検索して下さい。gene symbolが分からない時は『ジーンシンボルについて』を参照して下さい。
以下に実際の検索について解説します。
検索例1
- CD44遺伝子の発現を検索したい場合、遺伝子名にCd44と入れて「Search」ボタンを押す。
- AffymetrixのGene ChipにあるCd44に対する4種類のプローブが表示されます。(プローブが1種類の遺伝子は1行だけの表示です)
- それぞれプローブ名をクリックすると、次の画面で6系統(合計21匹分)のマウスの遺伝子発現結果が表示されます。また、それぞれのマウス系統内での平均値と、野生型マウス(WT)に対する相対的発現量の比率も表示されます。
- 引き続き他の遺伝子を検索する時は「Clear」ボタンを押してから、新たに検索する遺伝子名をいれて「Search」ボタンを押して下さい。
検索例2
- CCLケモカインの発現を検索したい場合、遺伝子名にCclと入れて「Search」ボタンを押す。
- 画面上にはCCL1からCCL28まで、Gene Chipに乗っているすべてのCCLケモカインファミリー遺伝子とそれぞれのプローブが表示されます。
- 調べたいCCL遺伝子のプローブを選択してクリックすると、6系統(合計21匹分)のマウスの遺伝子発現結果が表示されます。それぞれのマウス系統内での平均値と、野生型マウス(WT)に対する相対的発現量の比率も表示されます。
本検索システムはAffymetrix社のジーンチップ(Mouse Genome 430 2.0 Arrays)の解析結果を使っており、遺伝子によっては複数のプローブの結果があります。特定のプローブの結果について検索したい場合は、AffymetrixのプローブIDを入力して検索する事もできます。